煤炭开采会引起山体开裂、崩塌、滑坡和塌陷，加大了土壤的导水率，使土壤水分和养分大量流失，降低了土壤肥力，对农作物和树木生长构成了威胁。煤炭开采对水资源系统的破坏也十分严重。
采煤生产过程中采空范围不断扩大，形成整个开采过程的涌水高峰，地表水迅速向地下水转化，使地下水体由原来的横向运动为主变成了以纵向运动为主，破坏了浅层水源，严重影响了工农业用水。地表径流明显减少，地下水位大幅下降，造成房屋建筑开裂、地面沉降积水、河堤下沉、泄洪能力降低、泉水断流等一系列的问题。
例：1994年，享有盛名的晋祠难老泉由于煤炭过度开采，导致断流。煤炭开采对地表水的污染主要通过两个途径：矿坑排水和矸石淋溶直接对地表水流造成污染。矿坑水不仅混入大量的煤尘和有害元素，而且受到井下腐烂坑木、油类等严重的污染，排出地表后，直接使河道水流受到污染。矸石中含有大量的可溶性离子，特别是重金属离子，在地表水和地下水的冲刷、淋溶下，极易迁移到水中造成污染。
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